Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms