Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms