Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrcdQ00LT2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms