Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms