Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SeleQ00690 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms