Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms