Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp9bP98195 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp9bP98195 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp9bP98195 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp9bP98195 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp9bP98195 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms