Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms