Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms