Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smn1P97801 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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