Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcc1P97496 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms