Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Npas1P97459 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Npas1P97459 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Npas1P97459 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas1P97459 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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