Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bop1P97452 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bop1P97452 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms