Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms