Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lig3P97386 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms