Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms