Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim43bP86448 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim43bP86448 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms