Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms