Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms