Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcbP82349 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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