Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx1P81068 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms