Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms