Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms