Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms