Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufd1P70362 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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