Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux2P70298 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms