Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms