Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms