Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf6P70279 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf6P70279 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms