Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba4aP68368 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba4aP68368 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms