Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms