Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms