Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crabp1P62965 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms