Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rab3cP62823 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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