Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms