Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx1bP61264 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx1bP61264 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms