Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcbp1P60335 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms