Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarf2P59222 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms