Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms