Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms