Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms