Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtskP55097 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtskP55097 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CtskP55097 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtskP55097 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtskP55097 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtskP55097 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtskP55097 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtskP55097 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms