Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad23aP54726 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms