Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf9P54130 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms