Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PctpP53808 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PctpP53808 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms