Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cux1P53564 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Cux1P53564 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms