Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lbx1P52955 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lbx1P52955 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lbx1P52955 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lbx1P52955 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lbx1P52955 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lbx1P52955 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lbx1P52955 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lbx1P52955 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lbx1P52955 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms