Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms