Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms