Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms